Nella struttura di un farmaco organico, il numero e natura dei gruppi funzionali presenti, le dimensioni e forma della struttura molecolare determinano sia il profilo farmacocinetico che quello farmacodinamico. 

Nel corso verranno analizzate approfonditamente le relazioni che intercorrono fra la struttura di un composto organico e le sue proprietà chimico-fisiche (quali solubilità, punto di fusione o ebollizione, logP, tempo di ritenzione in un sistema cromatografico, …). Lo stesso percorso verrà quindi seguito applicando le relazioni sopra enunciate al Riconoscimento del Farmaco con particolare attenzione alle metodologie utilizzate nella Farmacopea Europea.